Борисоглебский музей ведет свою историю с 1913 года. Изначально созданный как городской музей наглядных пособий, в 1929 году он был преобразован в краеведческий музей. В 2001 году в связи с открытием подразделения — картинной галереи имени П.И. Шолохова — получил статус историко-художественного.
В 2013 году музей отметил свой 100-летний юбилей. В связи с этим событием администрацией Борисоглебского городского округа было принято решение о переводе музея в двухэтажный особняк конца XIX века, принадлежавший аптекарю Р.К. Вейсу.
Первая экспозиция «Сибирский коридор» в новом здании музея была открыта в конце 2015 года. Она посвящена первой в истории России «Выставке декабристов» и личности ее организатора — князя С.М. Волконского. Действуют экспозиции: «Борисоглебск купеческий», «ХХ век. Начало», «Археология Воронежского Прихоперья», «В оружии познание времен». На базе экспозиции действуют образовательные программы «Мир русской усадьбы» и «Город, история, люди». Также в музее работает кинолекционный зал и зал временных выставок.